結論から言うと「あります」。ただし、高速でチャンク（肉）を集めたい人にはあまり関係ないです。

トレハン、ドロップ率アップを入れることで「チャンク」「栄光の証」「SR武器」「SSR召喚石」「SSR武器」などが出る確率が増えます。

次の画像を使って詳細を説明します。

このドロップ画像は、Ex+を自発し、3位になったときのドロップ画像です。
ドロップ率アップに関係する条件としては、風見鶏Lv3、3凸兎、無凸カグヤ、トレハン9です。

赤枠で囲っている部分は、確定でドロップする箱です。
青枠で囲っている部分は、自発報酬の赤箱です。
緑枠で囲っている部分は、順位報酬の箱です。
黄枠で囲っている部分が、確率によって出現する箱、つまりトレハンなどによるドロップ率アップの影響を受ける箱です。

チャンク集めを重視する場合

トレハンを入れたり、カグヤなどの召喚石を装備して火力が下がることにより、討伐時間が著しく伸びる場合は、ドロップ率アップの努力をするより、素直に高速で討伐するか、2位を狙う方が効率が良いです。

過去の有志の検証結果では、チャンク収集の効率は2位＞MVP≒3位と判明していますので、可能であれば2位、それが無理ならMVPか3位を狙って高速周回するのが良いです。

もちろん、ドロップ率アップによって確率で出現する箱のドロップ率が増えるので、ドロップ率アップの工夫をしても高速でEx+を周回できる場合は、獲得できるチャンクの数が少し増えます。

栄光の証、SR武器、SSR召喚石なども欲しい場合

チャンクの他に、栄光の証、SR武器、SSR召喚石、SSR武器などを収集したい場合には、トレハンを入れる意味はあります。

ただし、SSR武器の出現確率はとても低いので、主に栄光の証やSR武器（餌用）を集めたい場合や、たまに出るSSR召喚石を砕いて虹色石やエレメントを集めたい場合に有効です。

↑トレハンアップで栄光の証がもらえるとうれしい。

↑確率箱、順位箱、自発箱でチャンクが出た場合こうなります。

↑確率箱（金）からSR武器、順位箱からアークエンジェル武器。

↑このように、Ex+からSSR武器も稀に出ます。トレハンを入れるとSSR武器のドロップ率が増えます。

参考

#ドロップ検証
決戦！星の古戦場

EX+に関しては自発赤箱の方がチャンク抽選率も高く、いいものが出る傾向にあります
HELLの赤箱についてはデータを集められていません pic.twitter.com/5DN51KsAoW

— すみ＠トレハン教徒 (@SSumiwatari) 2017年4月29日

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